1 封面
封面主要包含以下內容:項目(課題)名稱、申請者及其聯系方式(電子郵件和電話)、項目依托單位及相關信息。
(1)項目名稱應簡明扼要，明確、直接反映主要研究內容。國家自然科學基金項目名稱規定在50個漢字以內，江蘇省自然科學基金項目則限制在25字以內。
(2)申請者，也就是課題負責人，一般應具有中級以上職稱。國家自然科學基金面上項目要求申請者具備高級職稱，不具備者則必須有兩名同行高級職稱專家推薦方可申報。申請者的個人信息如電話和電子郵箱一定要填寫正確并且有效，以保證信息暢通無阻。
(3)項目依托單位名稱指申請者的工作單位，要填寫與單位公章一致的全稱，不得簡稱。我校申請者依托單位名稱應填寫“南京信息工程大學”，“南信大”、“南京信息工程大學××學院”的填寫方式都是錯誤的。
2 數據表
數據表，又叫簡表或基本信息表，需申請者認真逐項填寫。數據表主要包含以下8個欄目。
(1)資助類別指面上項目、重點項目、重大項目、指導性項目等，申請者應參照當年的《項目指南》和《項目管理辦法》并根據實際情況填寫。
(2)研究屬性可選擇下列類別填寫:基礎研究、應用基礎研究、應用研究、發展(開發)研究等。基礎研究指以認識自然現象、探索自然規律為目的，不直接考慮應用目標的研究活動。應用基礎研究指有廣泛應用前景，但以獲取新知識、新原理、新方法為主要目的的研究。應用研究指以增加科學技術知識，并為某種特定實際目的，探討新知識應用而進行的研究。發展(開發)研究指運用基礎研究和應用研究以及實驗的知識開發新材料、新產品、新裝置、新方法或對現有材料、方法作重大改進而進行的研究活動。國家自然科學基金一般以資助基礎研究和應用基礎研究為主。
(3)報審學科指申請項目所屬的學科，如涉及多學科可填寫2個，并先填為主學科。國家自然科學基金項目需要填寫申請代碼以表明項目所屬研究方向。由于該欄目涉及到項目評審專家的遴選，申請者一定要正確填寫。
(4)申請資助金額用阿拉伯數字表示，一般以萬元為單位。
(5)起止年月一般從申請次年的1月至完成年度的12月。
(6)參加單位數指項目組成員所在單位數，包括主持和合作單位。國家自然科學基金面上項目合作單位數不得超過2個。
(7)項目組主要成員指在項目組內，對學術思想、技術路線的制定、理論分析及對項目的完成起主要作用的人員。需要特別指出的是，項目組成員的專業應包括項目所涉及的主要學科，既要有較高水平的學科帶頭人，又要有掌握實驗技術、從事具體研究和操作的人員。要充分依靠和發揮中青年專家和科技人員的作用。成員數量按職稱高低一般呈塔狀分布，以5—8人為佳。其次，課題組成員項目分工要填寫具體，不宜籠統用“研究”“分析”之類的詞語，如果用“資料計算”“樣品采集”“分析測試”之類的詞匯就顯得分工明確、清楚;課題組成員安排的每年工作時間要充裕，一般填寫6—10個月較真實可信。
(8)研究內容摘要及關鍵詞。摘要字數有限，應精辟、高度濃縮，包括研究方法、途徑、手段以及要解決的問題、達到的目的、產生的效果等。關鍵詞的選取應恰當、能反映主要研究內容。
3 報告正文(課題論證報告)
報告正文是項目申請書的主體部分，這部分內容是說明: 1)為什么要做(why)，即立項依據是什么; 2)要做什么(what)，即研究目標、研究內容以及擬解決的關鍵問題是什么; 3)怎么做(how)，即采用何種研究方法、技術路線、實驗手段和關鍵技術等; 4)憑什么做，即有怎樣的研究基礎、工作條件以及項目組成員、經費預算等。
3.1 立項依據、研究內容、研究方案等(字數一般在4000~8000字)
3. 1. 1 立項依據
立項依據是指確立項目的科學依據，包括項目的研究意義、國內外發展動態以及相應的主要參考文獻。
(1)研究意義
要明確該問題的解決對推動相關學科有什么樣的科學價值，要從學術價值和應用前景的層面上來闡述。其中，是否具有創新意義是關鍵，應進行充分闡述。此外要表述對科技、經濟、社會發展的重要意義或應用前景。
(2)國內外發展動態及相應的參考文獻
申請者對申請項目所涉及研究領域的國內外研究狀況應有充分了解，在申請時要對國內外研究現狀、學術前沿、進展程度、發展趨勢、同行研究的新動向等加以闡述，并附主要的參考文獻。參考文獻的著錄并非簡單的拼湊，應是完整說明立項依據的有力輔證，應盡可能是最新的(經典文獻可略有涉及)、同行業內較權威的。
該部分可歸納分析為誰在做、做什么、做得怎樣、誰做得好或不足是什么、你打算怎么做才能更好?即: 1)問題來源是自己提出的，還是別人提出的，還是大家共知的問題; 2)與本項目相關的發展動態，哪些問題解決了，哪些還沒有解決好，問題的來龍去脈要敘述清楚，對國內外研究動態要有總體評價; 3)本人工作與他人工作的區別是什么?是否有人做過，做得如何?是否是別人做過而沒有解決好的等; 4)對國內外該領域的專家要有恰當的評價，評價時言辭要委婉客觀，自我評價要謙遜，盡量避免“首次發現”“首次研究”等用語。