而“一流大學建設高校”和“一流學科建設高校”，則是先有“一流學科建設高校”名單（137所），再在此基礎上選出“一流大學建設高校”（42所）。也就是說，先看一所大學有沒有若干個很強的學科（專業），再主要根據學科綜合實力來評定一所大學的強弱。
985是211的“升級版”（211包含985），“雙一流”則不存在交叉
如果說211是重點班，985就是重點班里的重點班。“985工程”大學均為教育部或其他中央部委直管，也稱部屬高校；除985外的“211工程”大學則多為省部共建高校，地方屬性更強一些。但985大學都是211大學。
“雙一流”則是兩個平行的評價體系。“一流大學建設高校”重在一流學科基礎上的學校整體建設、重點建設，全面提升人才培養水平和創新能力，共計42所，在原來39所985大學基礎上新增3所。
“一流學科建設高校”重在優勢學科建設，促進特色發展，共計95所。除了之前的大部分“非985”211大學，主要增加了26所特色明顯的高校。
985/211是固化的標簽，“雙一流”則是有進有出
雙一流計劃最根本性的不同是以學科為資助主體，且并不設終身制，每5年調整一次名單。
而“985”“211”是以學校為資助主體，名單形同“終身制”，據2009年至2013年的數據顯示，“211”和“985”高校拿走了全國七成的政府科研經費。